Самолеты скоро станут летать еще чаще в направлении российской столицы из Вильнюского аэропорта. В настоящее время «Аэрофлот» выполняет ежедневные рейсы из Вильнюса в Москву в первой половине дня, в 05:50 и 11:10. С 1 июля 2018 г.будет предложена возможность вылететь в аэропорт Шереметьево и в 18:45. Для значительной части пассажиров, направляющихся в Москву, Московский аэропорт становится промежуточной станцией для полетов в другие города России и соседние страны, а также в различные азиатские страны. Перелет из Вильнюса в Москву с «Airbus A320» занимает 1 час. 35 мин.